RRBS是一种主要用途于什么的技术?

(Reduced representation bisulfite sequencing) ，即简并代表性亚硫酸氢盐测序技术。是一种用于基因组单核苷酸级别的甲基化水平分析的高效的高通量测序技术。这项技术结合了限制性内切酶和亚硫酸氢盐测序，从而得到高CpG区域的富集信息。相比较全基因组甲基化测序技术，RRBS仅需要对基因组约1%的区域进行测序[1]，因此费用大大降低。

RRBS甲基化流程

分析流程

和普通的测序分析一致，首先fastqc质量检测，接着对序列进行修剪，修剪后再质量检测;如果质量检测通过，则进行序列回帖，然后去除重复，计算甲基化程度，以及一些后续分析，本次后续分析使用R包methlykit以及edmr，还有其他一些甲基化分析软件可以参见附录。